POP3-сервер прослуховує загальновідомий порт 110. Шифрування зв'язку для POP3 запитується після запуску протоколу за допомогою команди STLS (якщо вона підтримується), або POP3S, яка з'єднується з сервером, використовуючи TLS або SSL по TCP-порту 995.
IMAP (Англ. Internet Message Access Protocol) – протокол прикладного рівня для доступу до електронної пошти. MUA (Outlook Express, Opera, Mozilla Thunderbird, The Bat!, Claws Mail, mutt та ін.) Базується на транспортному протоколі TCP та використовує порт 143, а IMAPS (IMAP поверх SSL) – порт 993.